Etiología, clínica y evolución de infecciones fúngicas invasoras en pacientes con neoplasias hematológicas en un hospital universitario de Argentina

Introducción: Las infecciones fúngicas invasoras (IFI) en pacientes con neoplasias hematológicas (NH) representan un desafío diagnóstico y terapéutico. Objetivos: Describir la etiología, características clínicas, diagnóstico y evolución de los episodios de IFI probadas y probables en pacientes con NH y trasplante de progenitores hematopoyéticos (TPH). Pacientes y Métodos: Estudio descriptivo, retrospectivo y de cohorte que incluyó IFI probadas y probables en pacientes adultos con NH y TPH. Se realizó seguimiento hasta el día 90. Resultados: Se incluyeron 80 episodios de IFI: 49% probadas y 51% probables, 67,5% por hongos filamentosos (HF), 30% por hongos levaduriformes (HL) y 2,5% por hongos dimorfos. Los tipos de IFI más frecuentes fueron aspergilosis invasoras pulmonares (AP) y candidiasis invasoras (CI), en su mayoría por Candida spp. no albicans. Todos los casos de AP se diagnosticaron por detección de galactomanano en sangre y/o lavado broncoalveolar, y solamente 22,2% presentaban nódulos con halo en la tomografía computada (TC) de tórax, siendo los infiltrados inespecíficos los hallazgos más frecuentes. Tuvieron coinfección bacteriana y viral el 30 y 17,5%, respectivamente. El 50% fueron IFI de brecha, y la mortalidad global y mortalidad relacionada a la IFI fue 51 y 24%, respectivamente. Conclusión: Los HF fueron la principal causa de IFI, con una gran proporción de IFI de brecha, y presentaron elevada mortalidad. Para el diagnóstico, resulta importante la utilización de biomarcadores y jerarquizar cualquier imagen patológica en la TC.

Background: Invasive fungal infections (IFI) in patients with hematological malignancies (HM) represent a diagnostic and therapeutic challenge. Aim: To describe the etiology, clinical characteristics, diagnosis and evolution of proven and probable IFI episodes in patients with HM and hematopoietic stem cell transplantation (HSCT). Methods: Retrospective, descriptive, cohort study performed in adult patients with HM and HSCT, who developed proven and probable IFI. Follow-up was carried out until day 90. Results: A total of 80 IFI episodes were included: 49% proven and 51% probable, 67,5% due to mold (M), 30% to yeast-like fungi (Y) and 2,5% to dimorphic fungi. The most frequent causes were probable pulmonary aspergillosis (PA) and invasive candidiasis (IC), mainly due to non-albicans Candida species. PA were all diagnosed by detection of galactomannan (GM) in blood and bronchoalveolar lavage, and only 22,2% presented halo sign on chest CT. Bacterial and viral coinfections were reported in 30% and 17,5% respectively. Breakthrough IFI occurred in 50%, and global and IFI-related mortality were 51% and 24% respectively. Conclusion: Mold was the main cause of IFI, with a large proportion of breakthrough IFI, presenting high mortality. The use of biomarkers and the classification of any pathological image on CT contribute to the diagnosis.

Identificación directa de microorganismos a partir de hemocultivos positivos utilizando espectrometría de masas (MALDI-TOF MS) / Direct identification of microorganisms in positive blood culture bottles by mass spectrometry (MALDI-TOF MS)

Resumen La espectrometría de masas (MALDI-TOF MS) permite la identificación de microorganismos directamente de las colonias en pocos minutos. En este estudio se ha desarrollado y evaluado un protocolo reducido para identificar microorganismos directamente de las botellas de hemocultivos positivos en 30 minutos con una alta sensibilidad y especificidad, utilizando MALDITOF. Un total de 2535 hemocultivos positivos fueron estudiados por el método directo de MALDI-TOF MS, a partir de una alícuota de sangre de las botellas y el método de colonia, utilizando los cultivos desarrollados en medios sólidos. Del total de hemocultivos positivos incluidos en este estudio, 2381 (93,9%) fueron monomicrobianos y 146 (5,8%) polimicrobianos. Mil trescientos treinta (55,9%) de los aislamientos correspondieron a cocos gram positivos, 922 (38,7%) a bacilos gram negativos, 60 (2,5%) a anaerobios, 36 (1,5%) a bacilos gram positivos y 13 a levaduras. La concordancia global entre ambos métodos fue del 81,7% a nivel de especie (90,0% para bacilos gram negativos, 76,7% para cocos gram positivos y 33,3% para bacilos gram positivos). Se identificó al menos un germen en el 88% de las botellas positivas con desarrollo polimicrobiano. Los resultados del presente estudio demostraron que el protocolo basado en MALDI-TOF MS permite la identificación microbiana directamente de hemocultivos positivos en un tiempo corto, con una alta precisión, con excepción de los bacilos gram positivos.

Abstract Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) enables the identification of microorganisms directly from colonies within minutes. In this study this technology was adapted and tested for use with blood culture bottles, thus allowing identification in 30 minutes once the blood culture is detected as positive by the automate. A total of 2535 blood culture bottles reported as positive were tested by MALDI-TOF MS directly from positive blood culture bottles and colonies. A total of 2381 (93.9%) and 146 (5.8%) of the positive blood cultures were monomicrobial and polymicrobial, respectively. And 1330 (55.9%), 922 (38.7%), 60 (2.5%), 36 (1.5%) and 13 of the isolates were gram-positive cocci (GPC), gram-negative bacilli (GNB), anaerobic bacteria, gram-positive bacilli (GPB) and yeast respectively. Concordance between both methods was 81.7% (76.7% of GPC, 90% of GNB, 74.2% of anaerobic bacteria and 33.3% of GPB) in monomicrobial cultures. Eighty eight per cent of the polymicrobial cultures were identified correctly in at least one of the two bacteria. The results of the present study show that this fast, MALDI-TOF MS based method allows microbial identification directly from positive blood culture in a short time, with a high accuracy, with the exception of gram-positive bacilli.

Resumo A espectrometria de massa (MALDI-TOF MS) permite a identificação de microorganismos diretamente das colônias em minutos. Nesse estudo, foi desenvolvido um protocolo reduzido para identificar microrganismos diretamente das garrafas de hemoculturas positivas em 30 minutos com alta sensibilidade e especificidade, utilizando MALDI-TOF. Um total de 2535 hemoculturas positivas foram relatadas -o método direto de MALDI-TOF MS, a partir de uma alíquota de sangue dos vidros e o método de colônia, a partir das culturas desenvolvidas em meios sólidos. Do total de hemoculturas positivas incluídas neste estudo, 2.381 (93,9%) eram monomicrobianas e 146 (5,8%) eram polimicrobianas. Mil trezentos e trinta (55,9%) dos isolados corresponderam a cocos gram-positivos, 922 (38,7%) bacilos gram-negativos, 60 (2,5%) anaeróbios, 36 (1,5%) bacilos gram-positivos e 13 leveduras. A concordância geral entre os dois métodos foi de 81,7% em nivel de especie (90,0% para bacilos gram-negativos, 76,7% para cocos gram-positivos e 33,3% para bacilos gram-positivos). Pelo menos um germe foi identificado em 88% dos vidros positivos com desenvolvimento polimicrobiano. Os resultados do presente estudo demonstraram que o protocolo baseado em MALDI-TOF MS permite a identificação microbiana diretamente de hemoculturas positivas em um curto espaço de tempo, com alta precisão, com exceção de bacilos gram-positivos.

Fungemia following Saccharomyces cerevisiae var. boulardii probiotic treatment in an elderly patient / Fungemia posterior al tratamiento con Saccharomyces cerevisiae var. boulardii como probiótico en una paciente anosa

Abstract The yeast Saccharomyces cerevisiae var. boulardii is a biotherapeutic agent used for the prevention and treatment of several gastrointestinal diseases. We report a case of fungemia in a patient suffering from Clostridium difficile-associated diarrhea and treated with metronidazole and a probiotic containing S. cerevisiae var. boulardii. The yeasts isolated from the blood culture and capsules were identified by MALDI-TOF MS and API ID 32 C as S. cerevisiae, and showed the same appearance and color on CHROMAgar Candida. Treatment with fluconazole 400mg/day was initiated and the probiotic was stopped. The patient was discharged from hospital in good condition and was referred to a rehabilitation center. We suggest that the potential benefit of S. cerevisiae var. boulardii should be accurately evaluated, especially in elderly patients. Moreover, all physicians should be trained in the use of probiotic agents and enquire whether the use probiotics was included in the patients'medical histories. © 2019 Asociación Argentina de Microbiología. Published by Elsevier España, S.L.U. This is an open access article under the CC BY-NC-ND license (https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).

Resumen Saccharomyces cerevisiae var. boulardii es un agente bioterapéutico usado en la prevención y el tratamiento de varias enfermedades gastrointestinales. Informamos de un caso de fungemia en una paciente con diarrea asociada a Clostridium difficile, y tratada con metron-idazol y un probiótico que contenía S. cerevisiae var. boulardii. Las levaduras aisladas a partir del hemocultivo y del contenido de las cápsulas tomadas por la paciente se identificaron como S. cerevisiae mediante MALDI-TOF MS y API® ID 32C, las colonias mostraron el mismo color y aspecto en el medio CHROMAgar™ Candida. Se instauró un tratamiento con fluconazol 400mg/día y se suspendió el probiótico. La paciente fue dada de alta del hospital en buenas condiciones, y remitida a un centro de rehabilitación. Sugerimos que el beneficio potencial del uso de S. cerevisiae var. boulardii debe ser evaluado en cada paciente, especialmente en personas añosas. El uso de probióticos debería incluirse en los interrogatorios orientados al diagnóstico y formar parte de la historia clínica. © 2019 Asociación Argentina de Microbiología. Publicado por Elsevier España, S.L.U. Este es un artículo Open Access bajo la licencia CC BY-NC-ND (https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).